Mit der zunehmenden Forschung im Bereich der Vogelgenomik steigt auch der Bedarf an bioinformatischer Expertise und High Performance Computing (HPC). Durch die Kooperation mit der Universität Oldenburg profitiert das Institut für Vogelforschung (IfV) von der Expertise und Hardware der HPC-Einrichtungen.

Das hochmoderne Mehrzweck-Rechencluster ROSA bietet umfangreiche Ressourcen zur Unterstützung der bioinformatischen Forschung am IfV für eine Vielzahl unterschiedlicher genomischer Datentypen und Analysen, wie z.B.:

• High-coverage whole-genome re-sequencing Daten (short reads, long reads, linked reads)
• Epigenetische Daten (Methylierung, chromatin accessibility)
• Transkriptomische Daten (short read, long read, Einzelzelle)
• Analysen auf Populationsebene (Populationsstruktur, Populationsgeschichte, Merkmalsassoziationsstudien)
• phylogenomische Analysen (auf der Grundlage einzelner Gene oder des gesamten Genoms)

Bioinformatische Unterstützung von Analysen, die die HPC-Einrichtungen nutzen, wird von unserem ansässigen Bioinformatiker geleistet.